嵌合体序列指在pcr过程中,两条不同的序列产生杂交扩增的序列,属于人工污染,在ITS和16S分析中,应该首先去除,USearch提供去除嵌合体的功能 usearch -uchime_ref reads.fna -db reference.fna -strand plus -nonchimeras nonchimeras.fna usearch 链接:http://drive5.com/usearch/manual/uparse_cmds.html 同时usearch提供更加可靠的聚类方案(未详考

本节课程,需要先完成 扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类   先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们制作了Usearch要求格式的Fasta文件,对所有序列进行去冗余和低丰度过滤,并聚类生成了OTU.   接下来我们对OTU进一步去除嵌合体,并生成代表性序列和OTU表.   什么是chimeras(嵌合体)? 嵌合体序列

转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html 嵌合体序列:由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下: 在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例, 在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部分X序列延伸阶段就结束了,在下一轮的PCR反应中,这部分序列作为其相似序列Y的引物接着延伸,扩增就会形成X和Y的嵌合体序列: 在放一张具体一点的示意图,不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物,

DBImport V3.7介绍: 1:先上图,再介绍亮点功能: 主要的升级功能为: 1:增加(Truncate Table)清表再插入功能: 清掉再插,可以保证两个库的数据一致,自己很喜欢这个功能. 2:信息栏增加红色部分: 黑色的信息太多,有时候错误信息被淹陌,分拆出来单独红色块标识错误信息,清晰一些. 3:增加保存所有的配置及配置还原: 之前只保存数据库链接的配置,为了第4点,包起了所有的配置,包括表名等. 4:增加自启动参数,用于定时功能的开机启动: 自启动参数为 - true 或 - 1

第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞 当我们谈论桌面软件开发技术的时候,你会想到什么?如果不对技术本身进行更为深入的探讨,在我的世界里,有这么多技术概念可以被罗列出来(请原谅我本质上是一个Windows程序员的事实). 操作系统 API.操作系统发展到今日,几乎桌面应用的所有功能,都是基于系统API构建的.调用API和语言及技术无关,哪怕是使用汇编.例如(代码来源于网络,本地重新编译): ;我的第一个win32汇编程序 ;一个经典的hello world !程序 ;>>>>&

一.公司简介山东森普信息技术有限公司(以下简称森普软件)是一家专门致力于移动互联网产品.企业管理软件定制开发的技术型企业.公司总部设在全国五大软件园之一的济南齐鲁软件园.森普SimPro是由Simple+Professional组成,代表着公司一直秉承"森普,专业让管理更简单"的核心理念,致力于为广大的企业.政府客户提供操作简单.功能全面.技术专业的各种信息化产品及技术咨询服务.公司自2003年成立以来培养出了一支高素质,高水平,高专业,经验丰富的IT团队,并通过ISO9001认证(证

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在信息爆炸时代,如何避免持续性信息过剩,使自己变得专注而不是被纷繁的信息所累?每天会看到各种各样的新闻,各种新潮的技术层出不穷,如何筛选出自己所关心的? 各位看官会想,我们是来看开源软件的,你给我扯什么信息干嘛,别着急,听我慢慢道来. 背景 浏览器收藏夹应该是我们在收藏文章.网站的第一个利器,平时遇到喜欢的网站或者文章很方便的收藏到收藏夹中:很快我们的收藏夹就满了,于是就像我这样,创建文件夹来分组两层.三层都有: 有的也会借助百度首页导航这样的一些功能来整理自己收藏的网站,以前我记得QQ还有一款

近年来,企业级软件开发市场暗流汹涌,呈现出多种态势.软件开发团队规模趋于小型化,工作方式趋于快捷化,超过半数的软件开发者在工作中会选择使用易用的软件开发工具.随着流程管理越来越受到企业的重视,流程开发亦成为近年来炽手可热的软件开发项目之一. 然而,以往的流程项目通常采用开源流程平台或纯代码开发,表面上减少了费用,实际总体成本更高,一般存在项目周期不可控,项目质量不可控,交付产品扩展性差,后期维护难度大等问题.如今,H3 BPM作为优秀的流程开发工具,为软件开发者提供了优秀的解决方案. 易学易用,

随着互联网+.中国制造2025.工业4.0等国家战略的支持与引导,企业在数字经济时代的信息化表现惊人,越来越多企业认识到,对于企业的发展来说,信息自动化远远还不够,企业的战略.业务和IT之间需保持高度一致,在苦练IT外功的同时,强化管理内功,才能大力提升企业运营效率与质量. 如何帮助企业提高管理质量与效率,被誉为架起了企业业务部门与IT部门之间的沟通桥梁的BPM的人气似乎越来越旺.然而,虽然BPM在世界500强企业中已占据半壁江山,国内BPM的市场份额仍不容乐观. BPM到底是哪路神仙 谈到BP

我是小林,一名普通的软件工程师,从事BPM(业务流程管理)软件开发工作.我没有几十年的技术底蕴,无法像大牛们一样高谈阔论,品评BPM开发之道:也不是资深的流程管理专家,能与大家分析流程管理的时弊.我只是一名有着一轮工作经历的软件开发者,更准确说是流程开发者,有那么几次特殊的经历,可以窥探一丝BPM开发的发展轨迹. 2004年,我初入软件行业.当时,国内BPM软件产品大多还处在概念阶段,它们基本都是非常专业的中间件级产品,复杂的状态机.活动.事件等概念充斥其中,只有高水平的开发实施人员才能驾驭.而

敏捷软件开发:又称敏捷开发,是一种从1990年代开始逐渐引起广泛关注的一些新兴软件开发方法,是一种应对快速变化的需求的一种软件开发能力. 与传统软件工程相比,它们的具体名称.理念.过程.术语都不尽相同,相对于"非敏捷",更强调程序员团队与业务专家之间的紧密协作.面对面的沟通(认为比书面的文档更有效).频繁交付新的软件版本.紧凑而自我组织型的团队.能够很好地适应需求变化的代码编写和团队组织方法,也更注重软件开发中"人"的作用. 本文将介绍敏捷软件开发的历史背景与发展,

Atitit.软件开发的三层结构isv金字塔模型 第一层,Implements 层,着重与功能的实现.. 第二次,spec层,理论层,设计规范,接口,等.流程.方法论 顶层,val层,价值观层,原则,法则,定律等. 这一建构应从界定内涵出发,从器物.制度和意识形式三个层面厘定其表征:并结合发展轨迹,通过比较,探索.建构有利于“本土”文化,必须着力追寻能推动这一文化特质生成的进路,并以发挥其实践功效为归宿点和落脚点. 作者::  ★(attilax)>>>   绰号:老哇的爪子 ( 全名:

atitit.attilax的软件 架构 理念.docx 1. 预先规划.1 2. 全体系化1 3. 跨平台2 4. 跨语言2 5. Dsl化2 5.1. 界面ui h5化2 6. 跨架构化2 7. 尽可能的功能为独立组件化,2 8. 独立分布化2 9. Hybrid化,集成化2 10. Vm化,再次封装化2 11. 二次封装化2 1. 预先规划. 不用功能可隐藏,但要预留 2. 全体系化 .避免某一方面核心技术受制于人 3. 跨平台 4. 跨语言 5. Dsl化 作者::  ★(attilax

Atitit.研发管理软件公司的软资产列表指南 1. Isv模型下的软资产1 2. 实现层面implet1 3. 规范spec层1 4. 法则定律等val层的总结2 1. Isv模型下的软资产 Soft assets就是“软资产”,指人力资源(human resources).品牌(brand).技术(technology)及知识储备等资产,研发能力也是软资产 2. 实现层面implet 产品 ,框架,类库 作者::  ★(attilax)>>>   绰号:老哇的爪子 ( 全名::Att

"工欲善其事必先利其器",在利用OpenFoam解决我们的工程问题之前,首先要做的事情是搭建一个OpenFoam运行环境.很遗憾的是,OpenFoam的原生开发系统是Linux,因此对于习惯使用Linux操作系统的使用者来讲,自然不存在任何的问题,但是对于长期使用Windows操作系统的人,就需要掌握一些简单的Linux操作基础了.本文存在的目的即在于此. 1 软件的获取 OpenFoam的获取很简单,在其官方网站可以下载. 不同于Windows安装程序,在Linux下安装软件的步骤略

请尽量支持正版软件!https://www.jetbrains.com/ 本文仅供参考 以下提供一种方法可以无限期体验JetBrain2016系列软件. 1.下载JetbrainsCrack-2.5.6.jar. 百度盘链接:http://pan.baidu.com/s/1i5gDanj 密码:q0a7 2.将jar包放到jetBrain系列软件安装目录中的bin文件夹下. 例如我的CLion安装目录:D:\Program Files (x86)\JetBrains\CLion 2016.2.3

近期,Google开源了强大的自动化构建工具Bazel. 正好博主近期在使用china版的Bazel--腾讯自主开发的Blade,所以准备跟大家分享一下Google Bazel这个分布式构建系统的原理和使用方法. 以下是分享的目录: Google Bazel原理篇: Google分布式构建软件之第一部分:访问源代码 Google分布式构建软件之第二部分:构建系统如何工作 Google分布式构建软件之第三部分:分布式执行构建步骤 Google分布式构建软件之第四部分:分发构建结果 Bazel工具使

用Excel做出比肩任务管理软件的操作技巧 在项目管理中,网上有各种各样的工具可以选择,到底用哪个,曾一度困扰着我.我是一个有轻度强迫症的人,总是喜欢试用各种各样的系统,以比较他们之间的不同,试图选择出一个最完善的系统.但是,在比较完各种系统之后,发现总是有各种各样的缺点,而在实际的项目中,也总是有各种自己想要达到的效果没法实现.其实我们用Excel这个工具,就能达到大部分的项目管理功能. 一个示例 点击"这里"下载模板 示例中实现的功能包括 任务在7天之内新增的,则显示背景为黄色(按

Atitit各种SDM 软件开发过程SDP sdm的ddd tdd bdd设计 1.1. software development methodology (also known as SDM 1 1.2. 历史1 1.3. 常见方法2 1.4.  DDD Domain Drive Design,也就是领域驱动开发.2 1.5. Tdd TDD(测试驱动开发(Test-Driven Development)3 1.6. TFD -- Test First Development)3 1.7. B