首先,下载SHAPEIT. 按照里面的步骤安装完后,将vcf文件进行基因型定相,分四步走. 第一步,将vcf文件转化为plink二进制文件(.bed, .bim, .fam). 这一步需要用到GATK里的GenomeAnalysisTK工具,见如下命令: java -Xmx8g -jar GenomeAnalysisTK.jar -T VariantsToBinaryPed -R GRCh37.fa -V file.vcf --metaData sampleID.fam -mgq 0 -bed

前段时间,在学习试用FFmpeg播放音频的时候总是有杂音,网上的很多教程是基于之前版本的FFmpeg的,而新的FFmepg3中audio增加了平面(planar)格式,而SDL播放音频是不支持平面格式的,所以通过FFmpeg解码出来的数据不能直接发送到SDL进行播放,需要进行一个格式转换.通过网上一些资料,也能够正确的播放音频了,但是对具体的音频转换过程不是很了解,这里就对FFmpeg的对音频的存储格式及格式转换做个总结.本文主要有以下几个方面的内容: AVSampleFormat 音频samp

YUV格式具有亮度信息和色彩信息分离的特点,但大多数图像处理操作都是基于RGB格式. 因此当要对图像进行后期处理显示时,需要把YUV格式转换成RGB格式. RGB与YUV的变换公式如下: YUV(256 级别) 可以从8位 RGB 直接计算: Y = 0.299 R + 0.587 G + 0.114 B U = - 0.1687 R - 0.3313 G + 0.5 B + 128 V = 0.5 R - 0.4187 G - 0.0813 B + 128 反过来,RGB 也可以直接从YUV

Variant Call Format(VCF)是一个用于存储基因序列突变信息的文本格式.表示单碱基突变, 插入/缺失, 拷贝数变异和结构变异等.BCF格式文件是VCF格式的二进制文件. CHROM [chromosome]: 染色体名称. POS [position]: 参考基因组突变碱基位置,如果是INDEL(插入缺失),位置是INDEL的第一个碱基位置. ID [identifier]: 突变的名称.若没有,则用'.'表示其为一个新变种. REF [reference base(s)]:

/**  * 日期格式转换yyyy-MM-dd'T'HH:mm:ss.SSSXXX  (yyyy-MM-dd'T'HH:mm:ss.SSSZ) TO  yyyy-MM-dd HH:mm:ss  * @throws ParseException   */ public static String dealDateFormat(String oldDateStr) throws ParseException{  //此格式只有  jdk 1.7才支持  yyyy-MM-dd'T'HH:mm:ss.S

前言 最近由于项目需求,服务端由c#编写,客户端由java编写.通信数据使用RSA非对称加密.但是java和c#生成的密钥格式是不一样的,所以需要转换格式才可以正常使用.网上搜到使用java进行格式转换的代码(如:http://blog.csdn.net/road2010/article/details/40071881 ),本文将给出一种c#的实现方法. 密钥格式 java密钥格式如下: 私钥: MIICdwIBADANBgkqhkiG9w0BAQEFAASCAmEwggJdAgEAAoGBA

本文主要介绍如何使用GDI+对图片进行格式转换,可以转换的图片格式为bmp.jpg.png. 1.加载GDI+库 GDI+是GDI图形库的一个增强版本,提供了一系列Visual C++ API.为了使用GDI+,需要在工程中包含“GdiPlus.h”头文件,并加载“gdiplus.lib”库文件. 具体实现方法为,下载GDI+库,将下载得到的Gdiplus文件夹放到工程中.Gdiplus文件夹中应当包含有“GdiPlus.h”等一系列头文件.Gdiplus.lib库文件和Gdiplus.dll动

Oracle日期格式转换 本文主要介绍Oracle中的日期转换. 1. 日期转化为字符串 (以2016年10月20日为例) select to_char(sysdate,'yyyy-mm-dd hh24:mi:ss') strDateTime from dual; --获取年-月-日 时:分:秒 --显示结果为:2016-10-20 12:35:21 select to_char(sysdate,'yyyymmdd hh24:mi:ss') strDateTime from dual; --获取

在.net 中,调用 post 或者 get和后台通信时,如果有时间返回信息,后台返回的时间信息一般是这样格式:Thu Jul 9 23:14:53 UTC+0800 2015,那么要在前台显示就会有点点小困难.最近使用到,小小研究了下,参照网络中的写法,解决方法如下:1.先将C#的格式转换成js 的datetime形式. /* *将C#返回的日期格式进行转换 将 类似 Thu Jul 9 23:14:53 UTC+0800 2015 转换成 2015-05-06 *Parameters: *o

在上一篇博客<SpringMVC与MyBatis整合(一)——查询人员列表>中遗留了日期格式转换的问题,在这篇记录解决过程. 对于controller形参中pojo对象,如果属性中有日期类型,需要自定义参数绑定.         将请求日期数据串传成 日期类型,要转换的日期类型和pojo中日期属性的类型保持一致. 在上一篇的示例程序中,Person类属性如下:

JAVA和NET RSA密钥格式相互转换(公钥,私钥) 做了一个小项目遇到java和.net非对称加密问题,java的公钥和私钥就直接是一个字符串的形式展示的,但是.net是以xml简单包裹形式展示的,这样就会出现秘钥不一致的情况,导致java和.net加密与解密出现障碍, 首先,我们来看一下java端的私钥和公钥的样子: 私钥: MIICeQIBADANBgkqhkiG9w0BAQEFAASCAmMwggJfAgEAAoGBAL6VJN4ZkfZA3aPPgKC3xaqT/yZT5FOlQ5T

JavaScript时间格式转换总结 1.当前系统区域设置格式(toLocaleDateString和toLocaleTimeString) 例子:(new Date()).toLocaleDateString() + " " + (new Date()).toLocaleTimeString()结果: 2008年1月29日 16:13:112.普通字符串(toDateString和toTimeString) 例子: (new Date()).toDateString() + &quo

在SQL Server数据库中,SQL Server日期时间格式转换字符串可以改变SQL Server日期和时间的格式,是每个SQL数据库用户都应该掌握的.本文我们主要就介绍一下SQL Server日期时间转字符串的相关知识,接下来就让我们一起来了解一下这部分内容. 日期时间转字符串: Select CONVERT(varchar(100), GETDATE(), 0): 05 16 2006 10:57AM Select CONVERT(varchar(100), GETDATE(), 1):

在SQL Server数据库中,SQL Server日期时间格式转换字符串可以改变SQL Server日期和时间的格式,是每个SQL数据库用户都应该掌握的.本文我们主要就介绍一下SQL Server日期时间转字符串的相关知识,接下来就让我们一起来了解一下这部分内容. 日期时间转字符串: Select CONVERT(varchar(100), GETDATE(), 0): 05 16 2006 10:57AM Select CONVERT(varchar(100), GETDATE(), 1):

这个形式的格式转换符用于输出, 如果a <= b,  那么输出的字符串串长大于等于a, 小于b; 否则, 输出的串长按照a指定的输出. (不够,用空格补齐)

经常需要爬取网站上的时间信息,不同的网站又有不同的日期显示方式.而我需要将日期格式转化为一种特定的格式,所以为了简便和学习,记录下各种不同的日期格式转换. 日期格式化符号: %y :两位数的年份表示(00-99) %Y :四位数的年份表示(000-9999) %m :月份(01-12) %d :月内中的一天(0-31) %H :24小时制小时数(0-23) %I :12小时制小时数(01-12) %M :分钟数(00=59) %S :秒(00-59) %a :本地简化星期名称 %A :本地完整星

由于历史原因,导致Windows.Unix/Linux.Mac三者之间,对于文本中所用回车换行符,表示的方法,都不一样.这就导致了很多人都会遇到回车换行符的困惑,同时需要在不同格式间进行转换. 1)查看当前文本格式 Notepad++界面中,在右下角有文件格式的描述:“Dos\Windows或UNIX或Mac”.2)格式转换 编辑->档案格式转换->,其中可以进行三种文本格式的转换

文本文档格式查看 Linux下的文档格式查看方法 cat -A <filename> | grep "^M$", 如果存在^M$字符就是Dos格式. Windows下的文档格式查看方法 使用notepad++.UE等编辑器打开文件,可以在右下角看到文件格式和编码方式. 文本文档格式转换 Windows.Unix/Linux.Mac三者之间对于文本中所用回车换行符,表示方法不一致. 在不同系统之间需要针对文件内容中的回车换行符进行格式转换. Linux --- 格式转换 do

jsp 1.引用json.js(将json格式转换成字符串) 2. var name = document.getElementById("name").value; var retries = document.getElementById("retries").value; var testname = document.getElementById("testname").value; var testretries = document.

java在java.text   java.util   java.lang包中查找 import java.util.*; import java.text.*; public class Text{ public static void main(String[] args){ long curtime=System.currentTimeMillis();//调用系统当前距1970-1-1 08:00:00的毫秒秒数 System.out.println(curtime); Date t=

zw版[转发·台湾nvp系列Delphi例程]HALCON HImage与Bitmap格式转换 (Delphi Prism)namespace HImage_Bitmap_Prism;interfaceuses System.Drawing, System.Collections, System.Collections.Generic, System.Windows.Forms, System.ComponentModel, System.Drawing, System.Drawing.Imag